《拳皇2002》回归到了3对3的组队模式，打败一名对手后根据剩余时间回复的体力并进入下一回合，被对手打败时则换上队伍中的下一名待机角色，打败对方三名角色则胜出。

该作的能量槽回归了《拳皇98》的模式，名角色最多可储存3个能量槽，而后的第二名、第三名角色在继承名角色的能量槽后，将依次增加1个可储存能量槽。并且采用了可以通过消耗1个能量槽使角色发动MAX模式的系统。在该模式下，能量槽的上方将会出现计数器以表示MAX状态可持续的时间，并且在使用特定必杀技时可以通过消耗能量槽来取消出其他技能。此外，在地面通常技或特殊技使用的过程中可以按下“BC”键来取消技能硬直并直接发动MAX模式。通过这样的快速发动，亦可以进行没有间隙的连续技组合。

特殊操作

紧急回避

方向键+AB同时按下即可使用。

击飞攻击

CD键同时按下。

通常投

方向键+A or B

拆解投技

被对手的通常投抓住后输入与对手相同的通常投指令即可拆解。

受身

在被击落下降前同时按下AB按钮。

MAX发动

同时按下BC按钮（消耗1个能量槽）。

超必杀技

输入相应指令即可使用（消耗1个能量槽）。

MAX超必杀技

发动MAX的情况下，输入相应指令即可使用（消耗1个能量槽）。

挑拨

按住开始按钮即可进行。

隐藏人物

草薙

NEOGEO：在京头像上按↑↓→←↓↑←→即可呼出。

DC：Time Attack模式完成Lv.20后在京头像上按START键即可选出。

PS2：在京上按住“R1”即可选择。

Xbox：时间挑战模式中完成Lv.20后在京上按住R键即可选择。

卢卡尔·伯恩斯坦

NEOGEO街机版不可选择。

NEOGEO家用版：大门选择框下方的黑洞即为卢卡尔。

DC：击败Team Attack模式Lv.14出现的卢卡尔后即可使用。

干涸大地之社 荒狂稻光之夏尔米 炎之宿命之克里斯

在对应的角色上按住START键即可选出。

矢吹真吾

DC：击败Time Attack模式Lv.40出现的卢卡尔即可使用。

PS2/Xbox：组队挑战中打败14支队伍，即可使用。

琼

DC：通过Time Attack模式Lv.40即可使用。

PS2/Xbox：单人挑战模式中打败40人即可使用。

月之夜大蛇之血发狂的庵

通过Time Attack模式Lv.20，在八神庵头像按住R1即可使用。

高尼茨

通过Time Attack模式Lv.30，在卢卡尔头像上按住R1即可使用。

吉斯·霍华德

通过Time Attack模式Lv.40，在比利·凯恩头像上按住R1即可使用。