作为口袋妖怪首款游戏，初代虽然起到了启蒙作用，但是在系统设定上还有很多不成熟之处。奠定了游戏核心并积累了大量人气后，GameFreak开始着手制作了第二世代《口袋怪兽：金/银》，一举赢得玩家追捧，被誉为口袋妖怪系列口碑的续作游戏。
《口袋怪兽：金/银》发行在初代后的第三年（1999年），本来官方计划97年就在任天堂GameBoy上发行该续作，然而游戏多次延期之后，愣是拖到了GBC平台上。该续作和其他世代有很多不同之处，如果你是一名老玩家，肯定会发现《金/银》的故事并不像其他世代那么独立，而是与初代关都地区有千丝万缕的联系。
在1997年时《精灵宝可梦》同名动漫开播了集，本应该只讲述世代故事的剧情中直接出现了二代才有的传说宝可梦“凤王”，可见当时官方就已经开始下一盘大棋了。而且从《神奇宝可梦：特别篇》漫画中也能看得出，在第7卷完结后开启金银篇，还是会有很多熟悉的身影和剧情出现。种种与初代的联系，反馈在游戏中就是故事剧情被设定在了世代基础上，续写前作的剧情故事，甚至与世代共用一个联盟，这放眼后来续作是不曾出现过的。
此外，《口袋怪兽：金/银》是众世代中一个拥有双地图的正统续作。玩家悉心培养精灵，在城都地区通关之后便能解锁关都地区地图，这不仅在剧情上构成了无缝衔接，更是让玩家感受到了双倍的快乐。想想当自己觉得已经通关，恋恋不舍后，被告知游戏中居然还有一张地图，且这地图就是前一世代设定（竟然能挑战8个道馆！）之时能感受到多大的惊喜。此外，还加入了白银山洞窟，能与真主角-小智求得一战！
《口袋怪兽：金/银》能拿到系列高的评价，与双地图设定是脱不开关系的。后来玩家呼吁过多次希望后世代也能延续双地图传统，然而直到技术不可同日而语的《剑盾》，双地图仍然没有回归，真是可惜。
《口袋怪兽：金/银》的图鉴继承初代151只宝可梦的基础上，还新增了100只宝可梦，但是除了神兽凤王、路基亚，幻兽雪拉比、三圣兽炎帝、水君、雷公、准神班吉拉等为数不多的几只外，存在感普遍比初代要低很多。尤其在御三家火球鼠、菊草叶、小锯鳄，属性设计因为走得是纯系，战力方面公认比较薄弱，连人气也被初代压过太多。
自第二世代开始，口袋妖怪系列开始以神兽作为封面，金版凤王和银版路基亚的霸气引起了很多玩家的注意。游戏新增了时间系统，分为早中晚三个时段，随着时间不同，所能捕获的宝可梦也各不相同，再次增加了游戏的可玩性。不仅如此，随着特定日期的出现，还会有特殊事件、特殊宝可梦可以触发。
宝可梦跟随系统也满新奇，算是游戏的一个亮点，然而它也没能被传承下来。正统的口袋妖怪第二世代，资料片推出《水晶》版（以580圣兽为封面的版本）。后来在NDS上推出复刻游戏《心金/魂银》，再次掀起了第二世代口袋妖怪的热潮。怀念曾经那段迷恋二代的游戏时光，青春不再，回忆永存。
