在魔导院内的事件中，会有根据操作角色的不同来决定是否能触发的事件，调查特定的地点或者与特定的角色对话时就会出现切换操作角色的提示，这时候可以通过物终端来进行角色的切换。
世界地图
进入世界地图需要消耗6个小时的时间，当剩余时间小于6个小时的时候就无法走出世界地图。在世界地图里，角色的HP和MP都会默认为全满状态，在地图的战斗结束后都会自动回满，但是无法在大地图上复活死亡的角色。
在世界地图或者身处其他城镇时想要回到魔导院的话，可以直接从菜单中选择“返回魔导院”瞬间飞回去。
在地图上徘徊的魔物都是Lv99的强敌，一周目遇到它们的话有多远逃多远，逃不过的话要么使用传送石逃离战斗，要么等着它们将队伍全灭自动结束战斗。同时地图上还有着陆行鸟，靠近之后按○（A）键就能够抓取。
作战
当玩家在流程里进行过一次主线的作战或者实战演习之后，就能够在主标题页面的“作战”页面里读取存档，选择该存档里已经做过的作战或者实战演习进行游玩。期间获得的道具和经验值都可以继承到游戏本篇之中。但是当玩家的存档正处于进行作战或者实战演习的状态时是无法使用该存档来进行过去的“作战”的。
当遇到队友死亡人数太多或者战况极其不利的情况下可以打开菜单选择“中止作战”，这时候就能够回到作战开始前的状态。选择中止作战的话会失去战斗期间获得的道具、生命之源和支援点数，但是会保留经验值与技能点，而全灭的话这一切都不会保留。
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特殊任务（S.O.）系统
在魔法局与NPC对话可以开启特殊任务系统（简称S.O.系统）。在进行作战时画面上方就会出现S.O.任务的提示，按下触屏版（VIEW键）就能够打开S.O.任务界面。一般的S.O.任务图标都是白色的，在特定情况下会出现红色的图标，完成这类S.O.任务的话就能够立刻获得特殊报酬，除了武器和饰品之外，还会解锁魔法甚至是军神。
委托
与头上有“委”标志的NPC对话就能够接受委托，一次只能接一个，每次自由时间里接受的委托都必须在时间用完之前完成。
实战演习
从第三章开始，在魔导院的大门前与NPC对话就可以查看目前能进行的实战演习，进行实战演习总共需要花12个小时的时间。在一周目时，各实战演习作战的等级要求都比较高，如果一周目没自信的话可以等到二周目再去打。斗技场
从喷水广场往西边走可以进入斗技场，斗技场可以进行“模拟战斗”和“秘密特训”。
与左边的NPC对话可以进行模拟战斗，可参战的角色只有1人，战斗对象为2个皇国兵与1个强化兵的组合，将他们打败并吸收了生命之源后下一批敌人就会马上出现。模拟战斗可以获得少量经验值与生命之源，通过菜单的“中止作战”或者斗技场大门可以停止战斗。当体力为0时经验值与生命之源也会保留下来，而且不会导致GAME OVER。
与右边的NPC对话可以进行秘密特训，可参加的角色只有玩家目前操作的角色，在后期等级高难刷级的时候可以使用该功能来给角色攒经验值。秘密特训是在玩家没有进行游戏的时候给角色进行训练，等玩家过了一段时间重新打开游戏的时候角色就能够从其他教官处获得经验值或者提升角色参数。
飞空艇
由于本作有大地图，那么自然就不能少了飞空艇的存在。在一周目时想要入手飞空艇最早也要等到第七章。除此之外还能够在飞空艇起降所与物终端旁边的NPC对话，花钱进行飞空艇，不过可移动的范围于朱雀的势力范围内。
