在剧情推进方面，“碧之轨迹 改”仍然采用任务推进的方式，玩家可以自主选择推进主线剧情的时间。相对而言，也不必担心因为找不到触发剧情的地点而卡关。在主线剧情之外，丰富的支线任务，也是本作的一大亮点。除了可以获得各类奖励外，很多有意思的剧情，也都隐藏在支线任务中。要注意的是，支线剧情存在时间限制，玩家需要留意一下时间规划。
不正当交易的跟踪(隐藏)
期间：第二章第二天搜索小猫结束～进入空港
报酬：1500
取得DP：3(+2)
搜索小猫结束后在IBC前和格蕾丝对话任务开始
根据所选选项有DP加成
正确选项
艾莉=>‘積極的’
兰迪=>‘控えめ’
诺艾尔=>‘冷静’
由于需要选择角色，所以可能影响羁绊点数
克洛斯贝尔的向导
期间：第二章第三天
报酬：2500
取得DP：1(+5)
和特别任务支援科大楼**的利贝尔王国亲卫队对话开始任务
注意触发在克洛斯贝尔大圣堂墓地和科洛蒂娅王太女的小事件后将无法接受任务
选项有‘行政区の屋台’‘ベーカリー・モルジュ’‘旧市街 or アルカンシェル’三个
上述三个选项与选择顺序无关均可获得DP
森林道的探索
期间：第三章第三天”追踪飙车族“结束～前往湿地带前
报酬：3000
取得DP：5
和贝尔加德门队长室的索妮亚司令对话开始任务
移动方法和DP加成无关
拾取所有掉落物品
左边倒下的树木前方
宝箱前大片空地
水筒(绳索前树根处)=>沿绳索下去
右边岔路宝箱前
下一个地图入口前方=>进入下一个地图
有三个敌人的树根处
右边有个宝箱的T字路左侧
新弹壳(倒下的树木前方)
プロネマ草的旁边
旧式通信器(魔兽宝箱前)
隐蔽宝箱旁
倒下树木的前方
去过之后到回复装置前发生剧情结束
面包店的宣传
期间：第四章天
报酬：1500
取得DP(+2)
与西街面包店的莫尔治对话
为宣传面包店唱歌
选择角色不同，正解对应选项也不同
•艾莉 “情熱的に”△ “クールに”△ “かわいく”◎
•缇欧 “情熱的に”× “クールに”△ “かわいく”△
•兰迪“情熱的に”△ “クールに”△ “かわいく”×
•诺艾尔 “情熱的に”◎ “クールに”◎ “かわいく”×
•罗伊德“情熱的に”◎ “クールに”△ “かわいく”×
结束后任务完成，根据选择角色和选项可获得以下道具
◎ ‘極厚カツサンド’ DP3(+2)
△ ‘ベネットワンダフル’DP3(+1)
× ‘クリームメロンパン’DP3
由于需要选择角色，所以可能会影响羁绊点数
主题公园的打工2
期间：第四章天
报酬：500
取得DP：3(+3)
和在港湾区的汉克斯对话开始任务
需要事先完成第三章第二天的《主题公园的打工》任务
个选项：前に出る
第二个选项：みーしぇに近づく
一个选项： もう一度回る
选对一个DP+1
结束后任务完成，得到6个‘スポリタンX’
